崇禎又在300政治思想工作學員後麵畫了鮮紅雪亮一個紅色的對號：“100人給孫承宗孫大人；200人派給袁崇煥。袁崇煥這裡啊，承恩，你要多費些心思和他溝通一下，要把朕的這200學員用好，告訴他，這不是監軍，這是派到士卒中間去的鼓舞士氣的思想動員執行員。還要讓孫承宗告誡袁崇煥，不要搞什麼親兵製，讓他知道所有的兵都是他的親兵，然後你在親自把這話轉告他：不要搞什麼親兵製，讓他知道所有的兵都是他的親兵。就說這就是朕的意思！要他嚴行！”
同一道訓令，兩個分量極重的人分彆提點，那意義就不一樣了，估計袁崇煥不重視都不行。一箭雙鵰，順帶著給正在整編三大營的孫承宗也提了個醒，當孫承宗接到這道口諭時就想：看來皇帝對此事還是很重視的，皇帝可是給自己留足顏麵，冇有直接提醒自己，老臣領悟了！自己在組整編組軍時定會注意的。
尚書房。
崇禎望著王承恩：“朕，準備給你放個長假。這段時間，你一直伴著朕也辛苦了。你就帶著這200學員去趟江南，順帶著休息休息賞賞這天下的美景。至於袁崇煥那裡，讓他遵照執行即可。孫大人這裡就無需交代什麼了，他知道怎麼做。準備下，等內閣的事情一了，你就啟程吧。你不在的這段時間，就讓王坤來侍候吧，還是老人用著順手啊。”
王承恩心裡暖暖的，忙領命。他這即將開始的江南之旅極具傳奇色彩，這一去牽出了“慟哭六軍俱縞素，衝冠一怒為紅顏”的主人翁。
此時，一個執守太監匆匆跑來，到了門口停下腳步向裡張望，看的王承恩，忙揮手招呼。王承恩一看來人表情，就知道一定有急事，趕忙走到門口，與來人低語了幾句，示意來人稍等，轉身來到崇禎身旁：“皇爺，毛文龍來了，正在宮外侯旨。”
“速傳他進來！”崇禎內心一直期盼著這個富有爭議的將軍的到來。
為什麼說富有爭議呢？
先說他被袁崇煥擅殺此事吧：
天啟四年（1624年），朝廷就已經升毛文龍為太子太保、左都督了。這太子太保為三師之一，文職正一品，左都督為武職正一品，雖然都是虛職，可實打實的文武都是正一品“注意：文武兩套體係都是一品”，而且還有尚方劍。但是還是被袁崇煥給乾掉了！有什麼不對嗎？現在看看袁崇煥被上一世的崇禎重新重用後的官銜：為兵部尚書兼右副都禦史，督師薊﹑遼，兼督登﹑萊﹑天津軍務。其中，兵部尚書正二品，雖然兵部和五軍都督府的權力相當（可以這麼說：前者有權無兵，後者有兵無權），但品級畢竟差了一些。右副都禦史是正三品，督師並不是正式的官名，可以看作是一個臨時性的工作小組-就是總督薊﹑遼，兼督登﹑萊﹑天津軍務。袁崇煥以正二品的文職矯詔殺了文武職都是正一品，而且還有尚方劍的毛文龍的確是逾越。毛文龍不是他的下屬，嚴格說起來還是他的領導。看到了吧！即說明瞭袁崇煥真的膽大妄為，也說明瞭毛文龍真的很悲催。
再說被當做通敵叛國證據的與後金的書信往來此事：
自皇太極繼位後，改變了努爾哈赤過去的做法，重用漢官、善待漢人，後金統治日漸穩固；不久後，崇禎即位，銳意遼事，但性情過急。毛文龍在此一階段改變了反間策略：以投降歸順後金為餌，誘捕後金重要官員，希望藉此邀寵於崇禎帝。這就是與後金的書信往來的由來。
正反評價都不少，先看幾條正麵的評價：
董其昌：毛文龍以二百人奪鎮江，擒逆賊，獻之闕下，不費國家一把鐵、一束草、一鬥糧。立此奇功，真奇俠絕倫，可以寄邊事者！如此膽略，夫豈易得？使今有三文龍，奴可擄，遼可複，永芳、養性可坐縛而釁之鼓下矣。
袁可立：奴酋逆天順犯，於今七載。賴毛帥倡義，屢獲奇捷，大張撻伐之氣。據所報功級解驗，前後大小三十餘戰，斬首共一千九十七級數逾，上捷者共五次，總獲器械、弓箭等件共五萬。當我聖主宵旰之時，人心危懼之日，海外有此奇功，其應陛應賞應恤之官兵相應敕部，行巡按禦史覆勘，再為議序，以候俞旨施行。
陳liang訓：今日所恃海外長城者，非毛文龍者乎？
高汝栻：寧遠之役，奴擁眾入犯而終有內顧之慮者，殆文龍牽製之力歟。
吳惟英：昨夜營星色黯然，訃音忽向路人傳。但嗟韓信成擒日，不見蒙恬禦敵年。
功業已沉沙磧雨，精靈猶鎖海門煙。好收戰骨鴟夷裡，歸葬西湖嶽墓邊。
錢謙益：鴨綠江頭建鼓旗，間關百戰壯軍威。青天自許孤忠在，赤手親擒叛將歸。
夜靜舉烽連鹿島，月明傳箭過鼉磯。紛紛肉食皆臣子，絕域看君臥鐵衣。
再看對他的負mian評價：
薛國觀：今歲正月，敵傾巢入犯，雖稍挫凶鋒，而攻圍屠掠逍遙內地者直二十餘日，迨班師而東，演瀋陽，複圖再至，文龍一似不知有牽製者。
潘士聞：故智將動有成算，勇將所向無敵，未有翱翔海上八年，未複一城一池而可以言智；敵來深慝窮島，敵去仍言牽製而可以言勇。
楊國棟：設文龍於海外，原為牽製不敢西向也，數次過河，屢犯寧錦，全不知覺，牽製安在！
王永光：海外之師為牽製也，有須彌島之退，又有攻掠海州之報，以牽奴者而牽於奴，文龍伎倆已窮。
薑曰廣：其再至登州，則尤可異焉。舳艫相望、精甲耀目，非王浚之平江南戈船下瀨，豈呂蒙之襲荊州白衣搖櫓。一時各州縣城門日閉，人心惶惶。道臣王廷試婉言遜謝，今兵卒登岸，殺奪之尋端逐隙，不曰受我參貂若乾，則曰受我商人領狀若乾，不發一文，複邀至廟島，厲目相視，五部內不知所置。幸而小船遁歸，直至臣鄉撫按急為設處，始飽欲而去。稍拂其意，即不謂文龍此時遂破曆下，以開巷攻祝阿以發跡，又放兵四掠，嘯聚芒碭，馳驟淄墨圮顧，登萊一帶，首遭其屠戮矣！追論及此，文龍之心可誅，而肉足食乎？
謊報軍情事，崇禎肯定相信有:
《石匱書後集》：文龍僻處海島，去女真遠甚；揜襲戰功，以罔當寧。恐羽書不合，故急邸報耳。掩飾支吾，久當自敗。毛文龍以幺魔小卒，焉可上比鄂王。
袁可立：不交一鋒，致奴死二萬餘人，馬三萬匹，其數終有不可考。
崇禎始終相信，毛文龍孤懸敵後，強有力牽製了後金的精力而不敢扇動。袁崇煥斬毛文龍後，可說是為後金長驅南下解除了後顧之憂，三個月後就發生了後金兵臨北京城下的“己巳之變”—後金約十萬精兵繞道內蒙古，由喜峰口攻陷遵化，直迫明都北京。崇禎現在需要的就是把毛文龍的勢力做大做強，他就是釘在敵後的一根鋼釘，拔不動的鋼釘！也隻有毛文龍才能鎮得住皮島那幫子驕兵悍將。不至於島上的兵失去主帥後，漸漸地散了心，越發不可征用，以後直至有背叛投敵的現象發生。
正思慮間，尚書房門外傳來中老年人特有的低沉的聲音：“臣，毛文龍，參見吾皇萬歲，萬歲，萬萬歲。”
門外的毛文龍心情是非常忐忑不安的，有來自皇城那莫名的威壓，還有來自至高無上的皇權帶來的威壓，還有不知皇帝單獨召見自己到底會發生什麼那種未知帶來的壓力，綜合在一起，壓得這位久在邊關敵後，縱橫疆場的老將都有點喘不過氣來的感覺。
“毛愛卿，進來吧。”一聲不算嚴厲，還透著少許的溫和的年輕人特有的聲音傳出房間來。
“諾！”毛文龍趕緊應了聲諾，在王承恩的引領下，低著頭進到尚書房屋內（外臣未經許可是不敢抬頭看皇帝的）。